Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acsf3Q3URE1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acsf3Q3URE1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms