Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms