Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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