Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms