Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms