Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rmdn3Q3UJU9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms