Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Wdr41Q3UDP0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Wdr41Q3UDP0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms