Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cops9Q3U898 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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