Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Rnf180Q3U827 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf180Q3U827 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf180Q3U827 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf180Q3U827 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf180Q3U827 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf180Q3U827 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf180Q3U827 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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