Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms