Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hace1Q3U0D9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms