Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms