Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm21440Q3TTD8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm21440Q3TTD8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21440Q3TTD8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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