Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uri1Q3TLD5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uri1Q3TLD5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms