Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lpcat1Q3TFD2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lpcat1Q3TFD2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lpcat1Q3TFD2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lpcat1Q3TFD2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms