Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp8Q2V6D6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms