Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pi4k2aQ2TBE6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pi4k2aQ2TBE6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms