Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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