Protein–RNA interactions for Protein: Q14B48

Ccdc129, Coiled-coil domain-containing protein 129, mousemouse

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc129Q14B48 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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Ccdc129Q14B48 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc129Q14B48 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc129Q14B48 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms