Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp2b3Q0VF55 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms