Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms