Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms