Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
1700061G19RikQ08EE8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms