Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Calb2Q08331 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Calb2Q08331 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Calb2Q08331 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Calb2Q08331 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms