Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms