Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ebf1Q07802 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms