Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gdf3Q07104 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms