Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms