Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms