Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprgQ05909 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprgQ05909 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprgQ05909 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprgQ05909 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprgQ05909 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprgQ05909 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms