Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms