Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms