Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms