Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox8Q04886 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms