Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfdn6Q03958 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfdn6Q03958 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms