Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms