Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms