Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms