Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddr1Q03146 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms