Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GscQ02591 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GscQ02591 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GscQ02591 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms