Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd1Q02242 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms