Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VcpQ01853 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms