Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sec23aQ01405 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms