Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms