Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga4Q00651 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms