Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smn1P97801 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smn1P97801 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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