Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd3P97770 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms