Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
rp9P97762 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
rp9P97762 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
rp9P97762 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
rp9P97762 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms