Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms