Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps45P97390 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms